Der Gemeinderat ist die Exekutive der Politischen Gemeinde Bottighofen. Sie vertritt die Gemeinde nach aussen und vollzieht die Gesetze von Bund und Kanton sowie Beschlüsse der Gemeindeversammlung. Der Gemeinderat, welcher aus fünf Mitgliedern (Gemeindepräsident eingeschlossen) besteht, wird von den Stimmbürgerinnen und Stimmbürger für eine Amtsdauer von vier Jahren gewählt. Die Aufgaben des Gemeinderates sind in der Gemeindeordnung geregelt. Gleichzeitig ist er die Flurkommission. Jedes Behördenmitglied ist für einen bestimmten Aufgabenbereich (Ressort) zuständig.