In Bottighofen ist die, wie bei den meisten Gemeinden im Thurgau, Schule nicht in die Politische Gemeinde integriert sondern bildet eine eigene Körperschaft.
Für die Kindergärtler und Primaschüler steht im Dorf genügend Schulraum zur Verfügung und sämtliche Kinder können in Bottighofen Unterricht besuchen. Hier finden Sie den Link zum Internetauftritt der Primarschulgemeinde.
Zusammen mit Kreuzlingen und Lengwil gehört Bottighofen zum Oberstufenschulkreis Kreuzlingen. Alle Informationen sind auf diesem Link einsehbar.